[Appendix 1: molecular data matrix, from Wiens et al. 1999]
[numbers correspond to jarrovii populations in Fig. 3 and Appendix 1]
#NEXUS
BEGIN DATA;
DIMENSIONS NTAX=58 NCHAR=1856;
FORMAT MISSING=? GAP=- INTERLEAVE DATATYPE=DNA ;
OPTIONS MSTAXA=UNCERTAIN ZAP="1-15 234-240 360-363 903-921 929-959 1849-1856";
MATRIX
[ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
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830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 ]
[ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ]
[ ******* **** ******************* *******************************]
grammicus CGCGATGGGTCAATTAAAAATCCCCAAAAACATATAGTTTTGGTCCTAAACTTGCTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACCCCAGTGAATCATGCCCTAATAAAGCACAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACCATTAGCCCAAAACACCAAGCTCTGCCACACCCACACGGGCCTTCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAC-ACACCAATTT-A---AAGCTTGACTTAGTTATGATTAACA-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGGGCCCAAAGCAGTAGACCA-TCGGCGTAAATAGTGGCTAGAATACTGAACCGATACGTTAAAAATTAAACCATACCCTAACCGTAAAACACAGGCTAGATGAAACCAAGCATTTTT-AACAACGGGTAGTTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATTACAGCACTAAAATATCCGCCAGAAAATTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCACCTCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACTCCACGATAAACCTCACCAATCTTTGCCTAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCTACCTCATGAGAGAAGAGTAGTAAGTACAAGAGTTTAAT-AACTAGAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAGTGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAATATAAAACATAACGGCACGGTATTATGAAACTTTTACCTAAAGGAGGATTTAACAGTAAAACTAACAAGAAAGTTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCGCGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCATATAA-TAA-------ACACA--TATATAATCCTT-ATATTATT---CCCAAGATGAGG--
[974]
megalepidu ????????????????????????????????TATAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCGCACACCAGTGAAATATGCCCTAATAAAGCAAAAACGGAGCAGGTATCAGGCACAAACTCCAGCCCAAGACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCCCGCAGCAGTGATAAACATTAAGCTATAAGCGAT-ACACCAGACCTA---AAGCTTGACTTAGTTATGATTAATG-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGGGCCCAAAGCAGCAGACTT-TCGGCGTAAATAGTGGTTAGATTATTT-ACCAGCACATTAAAAACTAAACCTTATCCTAACCGTAAAACACAGGATAAATGAAGCCAAACATTTTTTAACGATAGGTACTTTGAACCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATAAGATATCACAATACTAAGGTATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCATACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTGTAATCGATACCCCACGTTAAACCTCACCAGTCTTTGCCTAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACGTACCTCATGAGAGAAGAATAGTAAGTGTAAAAGTTAAAC-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGATTGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAAAATAAAGCACA-CGGCACGGCATTATGAAACTTCTGCCTGAAGGTGGATTTAATAGTAAAACTAACAAGAAAATTAGTTTTAAATACGCTCTGGGGCGCGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTTATAAAA-TGT-----ATACACA--TACATAAACAAC-CAATTACC---CC------------
[934]
dugesii ?GCGATGGGTTAAT-AAAAATCCCCAAAAACACACAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTATTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGTATCCACATACCAGTGAAATATGCCCTAACATAGTATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACTAATAGCCAAAGACACCAAGCTTTGCCACGCCCACATGGGTCATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAACACACCAAAG-T-T-AAAGCTTGACTTAGTTATGATTAATA-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGGGCCCAAAGCAGCAGACTT-TCGGCGTAAATAGTGGCTAGAACAACT-ACCCCTGCATTAAAAATTAAACCATATCCTAACTGTAAAACACAGGCTAAATGAAATCAAGCACTTTT-AATAACAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGACATTATAATACTAAAATGTCCGCCAGAAAATTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGCACTCCATACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGCTAAACCTCACCAATCTTTGCCAAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTTAAT-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAATGGGAGAGATGGGCTACATTTTTTAAGATAAAACACA-CGGCATGGTACTATGAAACTTCTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAATTAACAAGAAAATTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCGCGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCACATAATCAC--------CTCA--TACATAATCAGC-TTTTACCCA-CCACAAGATGAGGCA
[976]
cyanog_A ??????????????????AATCCCCAAAAACACACAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACACCAGTGAAATACGCCCTAATACAGTATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACTATCAGCCAAAAACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCCATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAACACACCAAAC-T---AAAGCTTGACTTAGTTATGATTAATA-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGGACCCAAAGCAGCAGATTC-TCGGCGTAAATAGTGGCTAGAACAATT-ACCATCACATTAAAAACTAAACCATATCCTAACCGTAAAACACAGGCTAAATGAAATCAAACACTTTT-AATAGCAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATCATAATACTAAAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCATACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGATAAACCTCACCAATCTTTGCCAAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTTAAC-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAATGGGAGAGATGGGCTACATTTTTTAAAAAAAAACATA-CGGCACGGTACTATGAAACTCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAATTAACAAGAA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
[854]
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[972]
cyanog_C ??????GGGTCAAT-AAAAATCCCCAAAAACACACAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACACCAGTGAAATACGCCCTAATACAGTATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACTATCAGCCAAAAACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCCATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAACACACCAAAC-TA---AAGCTTGACTTAGTTATGATTAAT-AGGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGGGCCCAAAGCAGCAGATTC-TCGGCGTAAATAGTGGCTAGAACAATT-ACCATCACATTAAAAACTAAACCATATCCTAACCGTAAAACACAGGCTAAATGAAATCAAACACTTTT-AATAGCAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATCATAATACTAAAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCATACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGATAAACCTCACCAATCTTTGCCAAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTTAAC-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAATGGGAGAGATGGGCTACATTTTTTAAAATAAAACATA-CGGCACGGTACTATGAAACTCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAATTAACAAGAAAGTTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCACGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCACACAA-C-------ACACACA--TACATAATCAAC-ATTTTTAC---CACAAGATGAGGCA
[968]
cynst_1a CGAGACGGGTCAAT-AAAAATCCCCAAAAACACACAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACACCAGTGAAATACGCCCTAACACAGTATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACTGCCAGCCAAAAACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCCATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAACACACCAAAC-TA---AAGCTTGACTTAGTTATGATTAACA-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGGTGGGCCCAAAGCAGCAGACCC-TCGGCGTAAATAGTGGCCAGAATAATT-ACCCCCACATTAAAAACTAAACCATATCCTAACCGTAAAACGCAGGCTAAATGAAATCAAGCACTTTT-AATAGCAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATCATAATACTAAAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCATACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGCTAAACCTCACCAATCTTTGCCAAACCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTTAAT-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAATGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAAAATAAAACATAACGGCACGGTACTATGAAACTCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAACTAACAAGAAAGTTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCACGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCAAACAA-CACA-------CACA--TACATAATC-AACATTTTCCCCC--ACAAGATGAGGCA
[976]
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[971]
cynst_2a CGAGACGGGTCAAT-AAAAATCCCCAAAAACACATAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACACCAGTGAAATACGCCCTAACACAGTATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACCGCCAGCCAAAAACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCCCTCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAACACACCAAAC-T---AAAGCTTGACTTAGTTATGATTAACA-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTACACGGCGGGCCCAAAGCAGCAGACTC-TCGGCGTAAATAGTGGCCAGAATAATT-ACCCCCACATTAAAAACTAAACCATACCCTAACCGTAAAACACAGGCTAAATGAAATCAAGCACTTTT-AATAACAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATTATAGTACTAAAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCATACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGCTAAACCCCACCAATCTTTGCCATACCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTCAAT-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAATGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAAAGTAAAACATA-CGGCACGGTACTATGAAACGCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAACTAACAAGAAAGTTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCACGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCAAACAA-CACA-------CACA--TACATAATCAAC-ATTTTCTC---CACAAGATGAGGCA
[974]
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[961]
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[971]
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[971]
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[971]
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[969]
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[977]
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[970]
imm_6a ?????????????????????????AAAAACACACAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACACCAGTGAAATACGCCCTAACACAGCATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACTACTAGCCAAAAACACCAGGCTTTGCCACACCCACACGGGCCATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAAGACACCAAAC-TAT-AAAGCTTGACTTAGTTATGATTAATG-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGGGCCCAAAGCAGCAGACTC-TCGGCGTAAATAGTGGCTAGAATAGTT--CCCCCACATTAAAAACTAAACCATATCCTAACCGTAAAATATGGGCTAAATGAAATCAAACACTTTT-AATAACAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATTATAATACTAAAATATCCGCCAGAAGACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCACACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGTTAAACCTCACCAATCTTTGCCAAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTTAAT-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAATGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAAACTAAAACATA-CGGGACGGTACTATGAAACTCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAACTAAC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
[843]
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[965]
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[963]
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[972]
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[974]
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[969]
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[968]
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[973]
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[969]
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[959]
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[973]
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[961]
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[971]
min_17b ??????GGGCCGAT-AAAAATCCCCAAAAACACACAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACACCAGTGAAATACGCCCTAACATAGCATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACTACTAGCCAAAAACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCCATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAAGACACCAAAC-TAT-AAAGCTTGACTTAGTTATGATTAATG-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGGGCCCAAAGCAGCAGACAC-TCGGCGTAAATAGTGGCTAGAATAATT-ACCACCACATTAAAAACTAAACCATATCCTAACCGTAAAACATAGGCTAAATGAAATCAAACACTTTT-AATAACAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATTATGATACTAAAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCACACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGTTAAACCTCACCAATCTTTGCCAAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTTAAT-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAGTGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAAACTAAAACATA-CGGCACGGTACTATGAAACTCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAACTAACAAGAAAGTTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCGCGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCACACAA-CACA-------CATA--TACATAATCAAC-ATTTTCCT---CACAAGATGAGGCA
[970]
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[969]
min_15b ??????GGGCCAAT-AAAAATCCCCAAAAACACACAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACACCAGTGAAATACGCCCTAACACAGCATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACTACTAGCCAAAAACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCCATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAAGACACCAAAC-TAT-AAAGCTTGACTTAGTTATGATTAATG-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGGGCCCAAAGCAGCAGACAC-TCGGCGTAAATAGTGGCTAGAATAATT-ACCACCACATTAAAAACTAAACCATATCCTAACCGTAAAACATAGGCTAAATGAAATCAAACACTTTT-AATAACAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAGACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATTATGATACTAAAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCACACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGTTAAACCTCACCAATCTTTGCCAAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTTAAT-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAGTGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAAACTAAAACATA-CGGCACGGTACTATGAAACTCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAACTAACAAGAAAGTTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCGCGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCACACAA-CACA-------CATA--TACATAATCAAC-ATTTTCCCC---ACAAGATGAGGC-
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min_18a ??????GGGCCAAT-AAAAATCCCCAAAAACACACAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATTCACACACCAATGAAATACGCCCTAACACAGTATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACCCTAAGCCAAAAACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCCATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAACACACCAAA--TT--AAAGCTTGACTTAGTTATGATTAATG-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAAGGGCCCAAAGCAGCAGACTC-TCGGCGTAAATAGTGGCTAGAATAATTTACCACCACATTAAAAACTAAACCATGTCCTAACCGTAAAACATAGGCTAAATGAAATCAAACACTTTT-AATACCCGGTAGTTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATTATAATACTAAAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCACACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGTTAAACCTCACCAATCTTTGCCGAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTTAAT-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAATGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAAAATAAAACATAACGGCACGGTATTATGAAACTCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAACTAACAAGAAAGTTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCGCGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCACACAA-C-------ACACACA--TACATAATCAAC-ATTTTCTC---CACAAGATGAGGCA
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[976]
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[974]
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[971]
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[972]
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[961]
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[976]
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poinsettii ?????????????????GGTTCTAGCCGCTATCCTTCTAAAACTCGGGGGTTATGGTATTATACGAATTACAACATCACTAGCCCCACTTACGCCAAAACTTTACTACCCATTTATAATCCTTGCACTTTGAGGCATTGTTATAACAAGCTCGGTATGTATACGACAAACAGACCTAAAATCACTCATCGCTTACTCATCAGTTAGCCACATGGGACTAGTCATTGCAGCCTGCCTAATCCAAACACCATGAAGCTTCACAGGGGCCATAATTCTAATAATCGCACATGGACTCACTTCATCAATACTATTCTGCCTGGCAAACACAAACTATGAACGTACCCACACCCGAACAATAATGCTTGCCCGAGGATTCCAAATGATTCTTCCCCTTATATCAACCTGGTGACTTCTAGCAAACTTAACTAACATAGCACTACCACCATCAATTAACCTAATAGGAGAACTTCTTATCATCATTTCACTATTCAACTAGTCTAGCCCAACTATCTTATTAACGGGACTAGGAACACTAATCACAGCAATATATACACTTCACATATTTCTTACTACCCAACGAAACAAATTACCAACAAACATCAACTTTTCTGACCCCTCCCACACACGAGAGCACCTTCTAATAGCACTCCACCTAGCCCCCTTAATCCTTATTATCACAAAACCTGCCCTAATCTCAGGATTAATCAACTGTTAGTATAGTTTAACAAAAACATTAGGCAGTGGCCCTAAAAACAGAAGTTT-AACCCTTCTTACAAACCAAGAGGTGTCTTGAACACCAG--ACTGCTAATTCTTACTACTGAAGTTAAAGTCCTCAGACCTCTTACTTTTAAAGGATAGGAGTAATCCAATGGTCTTAGGCGCCAAAAACC?????
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sug_21b CCAATTGCAGGATCAATAGTTCTAGCCGCTGTCCTTCTAAAACTAGGGGGTTACGGTATTATACGAATCACAATAGCACTAACCCCAATTACCCCAAAACTCTATTACCCATTTATAGTCCTTGCACTTTGAGGTATCGTCATAACGAGCTCAATTTGCATACGACAAACAGACCTAAAATCACTCATTGCCTACTCATCAGTAAGCCACATAGGACTAGTCATTGCAGCCTGCCTGATCCAAACACCATGAAGCTTCACCGGAGCCATAATTCTAATAATCGCACATGGCCTCACTTCATCAATACTATTCTGCCTGGCAAACACAAACTATGAACGAACCAACACCCGAACAATGATACTTGCCCGGGGCTTCCAAATGATTCTCCCCCTTATATCAACCTGGTGGCTTCTAGCAAATTTAACCAACATAGCACTACCCCCATCAATTAACCTAATGGGAGAACTTCTCATCATTATCTCACTTTTCAACTGATCTAATCCAACAATCTTATTAACTGGACTAGGAACACTGATTACAGCAATATATACACTTCACATATTCCTCACTACCCAGCGTAGTAAACTACCAACAAACATTAACCTTTCTGACCCAACCCACACACGAGAACACCTTCTAATAATACTCCACCTAGCCCCACTAATCCTTATTATCACAAAACCTGCCCTAATCTCAGGCTTAATCAACTGTTAGTATAGTTTAACAAAAACATTAGGCAGTGGCCCTAGAAACAGAAGTTT-AACCCTTCTTACAAACCAAGAGGTGTCTTGAACACCAAGAACTGCTAATTCTTACTACTGAAGTTAAAATCCTCAGACCTCTTACTTTTAAAGGATAAAAGTAATCCAATGGTCTTAGGAACCAAAAA???????
[896]
torquatus CCAATTGCAGGATCAATGGTRCTAGCCGCCATTCTCCTAAAACTCGGAGGCTACGGCATTATACGCATCACAATATCACTAACCCCTATTACCCCAAAACTCTATTACCCATTTATAATCCTTGCATTATGGGGCATTGTTATAACAAGTTCAATTTGCATGCGACAAACAGACCTAAAATCACTTATCGCCTACTCATCAGTCAGCCACATGGGCTTAGTCATCGCAGCATGCCTAATCCAAACACCATGAAGCTTTACAGGCGCTATAATCCTAATAATCGCACACGGCCTTACCTCATCAATATTATTCTGTCTAGCTAACACAAACTACGAGCGAACTCACACCCGAACAATAATACTGGCCCGCGGCTTCCAAATTATCCTTCCACTTATGTCAACCTGGTGGCTCCTAGCGAACTTAACCAACATAGCACTACCCCCATCAATTAATCTAATAGGAGAACTTCTTATCATTATTTCACTATTCAACTGATCTAACCCGACAATTTTAATGACAGGACTAGGAACACTAATTACAGCAGTATACTCACTCCACATGTTCCTTATTACCCAACGAAATAAACTACCAACAAGCATTAATTTTTCTGACCCATCTCACACACGAGAACACCTCCTAATAATTCTTCACCTGGCCCCACTAACACTTATTATTGCAAAACCCGCCCTTATCTCAGGCCTGATCAACTGTTAGTATAGTTTAATAAAAACATTAGGCAGTGGCCCTAAAAATAGAAGTTC-AACCCTTCTTACAGACCAAGGGGTGTTTTGAACACCAAGAACTGCTAATTCTTACTACTGAAGTTAAAATCCTCAGACCTCTTACTTTTAAAGGATAAAAGTAATCCATTGGTCTTAGGA???????????????
[896]
;
END;
BEGIN TREES;
TRANSLATE
1 grammicus,
2 megalepidu,
3 dugesii,
4 cyanog_A,
5 cyanog_B,
6 cyanog_C,
7 cynst_1a,
8 cynst_1b,
9 cynst_2a,
10 cynst_2b,
11 ery_3,
12 ery_4a,
13 ery_4b,
14 imm_5c,
15 imm_5a,
16 imm_5b,
17 imm_6a,
18 imm_6b,
19 imm_III,
20 insignis,
21 jarr_8,
22 jarr_7a,
23 jarr_7b,
24 lineo,
25 min_9a,
26 min_14a,
27 min_14b,
28 min_9b,
29 min_17a,
30 min_17b,
31 min_15a,
32 min_15b,
33 min_16a,
34 min_16b,
35 min_18a,
36 min_18b,
37 min_10b,
38 min_10a,
39 min_12a,
40 min_12b,
41 min_11a,
42 min_11b,
43 min_13a,
44 min_13b,
45 min_IIa,
46 min_IIb,
47 mucronatus,
48 obe_19a,
49 obe_19b,
50 obe_20a,
51 obe_20b,
52 obe_Ia,
53 obe_Ib,
54 ornatus,
55 poinsettii,
56 sug_21a,
57 sug_21b,
58 torquatus
;
TREE * UNTITLED = [&R] (2,(1,(3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47,48,49,50,51,52,53,54,55,56,57,58)));
ENDBLOCK;
[Appendix 1: molecular data matrix, from Wiens et al. 1999]
[numbers correspond to jarrovii populations in Fig. 3 and Appendix 1]
#NEXUS
BEGIN DATA;
DIMENSIONS NTAX=58 NCHAR=1856;
FORMAT MISSING=? GAP=- INTERLEAVE DATATYPE=DNA ;
OPTIONS MSTAXA=UNCERTAIN ZAP="1-15 234-240 360-363 903-921 929-959 1849-1856";
MATRIX
[ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 ]
[ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ]
[ ******* **** ******************* *******************************]
grammicus CGCGATGGGTCAATTAAAAATCCCCAAAAACATATAGTTTTGGTCCTAAACTTGCTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACCCCAGTGAATCATGCCCTAATAAAGCACAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACCATTAGCCCAAAACACCAAGCTCTGCCACACCCACACGGGCCTTCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAC-ACACCAATTT-A---AAGCTTGACTTAGTTATGATTAACA-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGGGCCCAAAGCAGTAGACCA-TCGGCGTAAATAGTGGCTAGAATACTGAACCGATACGTTAAAAATTAAACCATACCCTAACCGTAAAACACAGGCTAGATGAAACCAAGCATTTTT-AACAACGGGTAGTTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATTACAGCACTAAAATATCCGCCAGAAAATTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCACCTCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACTCCACGATAAACCTCACCAATCTTTGCCTAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCTACCTCATGAGAGAAGAGTAGTAAGTACAAGAGTTTAAT-AACTAGAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAGTGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAATATAAAACATAACGGCACGGTATTATGAAACTTTTACCTAAAGGAGGATTTAACAGTAAAACTAACAAGAAAGTTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCGCGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCATATAA-TAA-------ACACA--TATATAATCCTT-ATATTATT---CCCAAGATGAGG--
[974]
megalepidu ????????????????????????????????TATAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCGCACACCAGTGAAATATGCCCTAATAAAGCAAAAACGGAGCAGGTATCAGGCACAAACTCCAGCCCAAGACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCCCGCAGCAGTGATAAACATTAAGCTATAAGCGAT-ACACCAGACCTA---AAGCTTGACTTAGTTATGATTAATG-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGGGCCCAAAGCAGCAGACTT-TCGGCGTAAATAGTGGTTAGATTATTT-ACCAGCACATTAAAAACTAAACCTTATCCTAACCGTAAAACACAGGATAAATGAAGCCAAACATTTTTTAACGATAGGTACTTTGAACCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATAAGATATCACAATACTAAGGTATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCATACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTGTAATCGATACCCCACGTTAAACCTCACCAGTCTTTGCCTAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACGTACCTCATGAGAGAAGAATAGTAAGTGTAAAAGTTAAAC-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGATTGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAAAATAAAGCACA-CGGCACGGCATTATGAAACTTCTGCCTGAAGGTGGATTTAATAGTAAAACTAACAAGAAAATTAGTTTTAAATACGCTCTGGGGCGCGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTTATAAAA-TGT-----ATACACA--TACATAAACAAC-CAATTACC---CC------------
[934]
dugesii ?GCGATGGGTTAAT-AAAAATCCCCAAAAACACACAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTATTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGTATCCACATACCAGTGAAATATGCCCTAACATAGTATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACTAATAGCCAAAGACACCAAGCTTTGCCACGCCCACATGGGTCATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAACACACCAAAG-T-T-AAAGCTTGACTTAGTTATGATTAATA-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGGGCCCAAAGCAGCAGACTT-TCGGCGTAAATAGTGGCTAGAACAACT-ACCCCTGCATTAAAAATTAAACCATATCCTAACTGTAAAACACAGGCTAAATGAAATCAAGCACTTTT-AATAACAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGACATTATAATACTAAAATGTCCGCCAGAAAATTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGCACTCCATACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGCTAAACCTCACCAATCTTTGCCAAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTTAAT-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAATGGGAGAGATGGGCTACATTTTTTAAGATAAAACACA-CGGCATGGTACTATGAAACTTCTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAATTAACAAGAAAATTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCGCGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCACATAATCAC--------CTCA--TACATAATCAGC-TTTTACCCA-CCACAAGATGAGGCA
[976]
cyanog_A ??????????????????AATCCCCAAAAACACACAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACACCAGTGAAATACGCCCTAATACAGTATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACTATCAGCCAAAAACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCCATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAACACACCAAAC-T---AAAGCTTGACTTAGTTATGATTAATA-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGGACCCAAAGCAGCAGATTC-TCGGCGTAAATAGTGGCTAGAACAATT-ACCATCACATTAAAAACTAAACCATATCCTAACCGTAAAACACAGGCTAAATGAAATCAAACACTTTT-AATAGCAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATCATAATACTAAAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCATACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGATAAACCTCACCAATCTTTGCCAAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTTAAC-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAATGGGAGAGATGGGCTACATTTTTTAAAAAAAAACATA-CGGCACGGTACTATGAAACTCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAATTAACAAGAA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
[854]
cyanog_B ??CGRWGGGTCAAT-AAAAATCCCCAAAAACACACAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACACCAGTGAAATACGCCCTAATACAGTATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACTATCAGCCAAAAACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCCATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAACACACCAAAC-TA---AAGCTTGACTTAGTTATGATTAATA-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGGACCCAAAGCAGCAGATTC-TCGGCGTAAATAGTGGCTAGAACAATT-ACCATCACATTAAAAACTAAACCATATCCTAACCGTAAAACACAGGCTAAATGAAATCAAACACTTTT-AATAGCAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATCATAATACTAAAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCATACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGATAAACCTCACCAATCTTTGCCAAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTTAAC-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAATGGGAGAGATGGGCTACATTTTTTAAAATAAAACATA-CGGCACGGTACTATGAAACTCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAATTAACAAGAAAGTTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCACGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCACACAA-CACA-------CACA--TACATAATCAAC-ATTTTTACC---ACAAGATGAGGCA
[972]
cyanog_C ??????GGGTCAAT-AAAAATCCCCAAAAACACACAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACACCAGTGAAATACGCCCTAATACAGTATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACTATCAGCCAAAAACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCCATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAACACACCAAAC-TA---AAGCTTGACTTAGTTATGATTAAT-AGGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGGGCCCAAAGCAGCAGATTC-TCGGCGTAAATAGTGGCTAGAACAATT-ACCATCACATTAAAAACTAAACCATATCCTAACCGTAAAACACAGGCTAAATGAAATCAAACACTTTT-AATAGCAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATCATAATACTAAAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCATACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGATAAACCTCACCAATCTTTGCCAAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTTAAC-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAATGGGAGAGATGGGCTACATTTTTTAAAATAAAACATA-CGGCACGGTACTATGAAACTCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAATTAACAAGAAAGTTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCACGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCACACAA-C-------ACACACA--TACATAATCAAC-ATTTTTAC---CACAAGATGAGGCA
[968]
cynst_1a CGAGACGGGTCAAT-AAAAATCCCCAAAAACACACAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACACCAGTGAAATACGCCCTAACACAGTATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACTGCCAGCCAAAAACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCCATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAACACACCAAAC-TA---AAGCTTGACTTAGTTATGATTAACA-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGGTGGGCCCAAAGCAGCAGACCC-TCGGCGTAAATAGTGGCCAGAATAATT-ACCCCCACATTAAAAACTAAACCATATCCTAACCGTAAAACGCAGGCTAAATGAAATCAAGCACTTTT-AATAGCAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATCATAATACTAAAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCATACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGCTAAACCTCACCAATCTTTGCCAAACCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTTAAT-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAATGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAAAATAAAACATAACGGCACGGTACTATGAAACTCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAACTAACAAGAAAGTTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCACGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCAAACAA-CACA-------CACA--TACATAATC-AACATTTTCCCCC--ACAAGATGAGGCA
[976]
cynst_1b ?????CGGGTCAAT-AAAAATCCCCAAAAACACACAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACACCAGTGAAATACGCCCTAACACAGTATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACTGCCAGCCAAAAACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCCATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAACACACCAAAC-TA---AAGCTTGACTTAGTTATGATTAACA-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGGTGGGCCCAAAGCAGCAGACCC-TCGGCGTAAATAGTGGCCAGAATAATT-ACCCCTACATTAAAAACTAAACCATACCCTAACCGTAAAACACAGGCTAAATGAAATCAAGCACTTTT-AATAGCAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATCATAATACTAAAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCATACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGCTAAACCTCACCAATCTTTGCCAAACCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTTAAT-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAATGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAAAATAAAACATAACGGCACGGTACTATGAAACTCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAACTAACAAGAAAGTTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCACGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCAAACAA-CACA-------CACA--TACATAATC-AACATTTTCCCCC--ACAAGATGAGGCA
[971]
cynst_2a CGAGACGGGTCAAT-AAAAATCCCCAAAAACACATAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACACCAGTGAAATACGCCCTAACACAGTATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACCGCCAGCCAAAAACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCCCTCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAACACACCAAAC-T---AAAGCTTGACTTAGTTATGATTAACA-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTACACGGCGGGCCCAAAGCAGCAGACTC-TCGGCGTAAATAGTGGCCAGAATAATT-ACCCCCACATTAAAAACTAAACCATACCCTAACCGTAAAACACAGGCTAAATGAAATCAAGCACTTTT-AATAACAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATTATAGTACTAAAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCATACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGCTAAACCCCACCAATCTTTGCCATACCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTCAAT-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAATGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAAAGTAAAACATA-CGGCACGGTACTATGAAACGCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAACTAACAAGAAAGTTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCACGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCAAACAA-CACA-------CACA--TACATAATCAAC-ATTTTCTC---CACAAGATGAGGCA
[974]
cynst_2b ?????????????T-AAAAATCCCCAAAAACACATAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACACCAGTGAAATACGCCCTAACACAGTATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACCGCCAGCCAAAAACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCCCTCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAACACACCAAAC-T---AAAGCTTGACTTAGTTATGATTAACA-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTACACGGCGGGCCCAAAGCAGCAGACTC-TCGGCGTAAATAGTGGCCAGAATAATT-ACCCCCACATTAAAAACTAAACCATACCCTAACCGTAAAACACAGGCTAAATGAAATCAAGCACTTTT-AATAACAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATTATAGTACTAAAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCATACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGCTAAACCCCACCAATCTTTGCCATACCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTCAAT-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAATGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAAAGTAAAACATA-CGGCACGGTACTATGAAACGCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAACTAACAAGAAAGTTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCACGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCAAACAA-CACA-------CACA--TACATAATCAAC-ATTTTCTC---CACAAAATGAGGCA
[961]
ery_3 ??????GGGCCAAT-AAAAATCCCCAAAAACACACAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACACCAGTGAAATACGCCCTAACACAGTATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACTACTAGCCAAAAACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCCATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAAAACACCAAAC-TATTAAAGCTTGACTTAGTTATGGTTAATG-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGGGCCCAAAGCAGCAGACTA-TCGGCGTAAATAGTGGCTAGAATAATT-ACCACCACATTAAAAACTAAACCATACCCTAACCGTAAAACATAGGCTAAATGAAATCAAACACTTTT-AATAACAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATTATGATACTAAAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCACACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGTTAAACCTCACCAATCTTTGCCAAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTTAAT-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAATGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAAACTAAAACATA-CGGCACGGTACTATGAAACTCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAACTAACAAGAAAGTTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCGCGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCACACAA-CACA-------CACA--TACATAATC-AACATTTTCCCC---ACAAGATGAGGCA
[971]
ery_4a ????ATGGGCCAAT-AAAAATCCCCAAAAACACACAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACACCAGTGAAATACGCCCTAACACAGTATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACTACTAGCCAAAAACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGTCATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAAAACACCAAAC-TATTAAAGCTTGACTTAGTTATGATTAATG-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGGGCCCAAAGCAGCAGACTC-TCGGCGTAAATAGTGGCTAGAATAATT-ACCACCACATTAAAAACTAAACCATATCCTAACCGTAAAACATAGGCTAAATGAAATCAAACACTTTT-AATAACAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATTATAATACTAAAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCACACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGTTAAACCTCACCAATCTTTGCCAAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTTAAT-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAATGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAAACTAAAACATA-CGGCACGGTACTATGAAACTCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAACTAACAAGAAAGTTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCGCGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCACACAA-CACA-------CATA--TACATAATCAAC-ATTTTCCC---CACAAGATGAGG--
[971]
ery_4b ??CGRWGGGCCAAT-AAAAATCCCCAAAAACACACAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACACCAGTGAAATACGCCCTAACACAGTATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACTACTAGCCAAAAACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGTCATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAAAACACCAAAC-TATTAAAGCTTGACTTAGTTATGATTAATG-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGGGCCCAAAGCAGCAGACTC-TCGGCGTAAATAGTGGCTAGAATAATT-ACCACCACATTAAAAACTAAACCACATCCTAACCGTAAAACATAGGCTAAATGAAATCAAACACTTTT-AATAACAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATTATAATACTAAAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCACACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGTTAAACCTCACCAATCTTTGCCAAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTTAAT-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAATGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAAACTAAAACATA-CGGCACGGTACTATGAAACTCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAACTAACAAGAAAGTTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCGCGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCACACAA-CACA-------CATA--TACATAATCAAC-ATTTTCCC---CACAA-AT-AGG--
[971]
imm_5c ??????GGGCCAAT-AAAAATCCCCAAAAACACACAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACACCAGTGAAATACGCCCTAACACAGTATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACTACTAGCCAAAAACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCCATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAAAACACCAAAC-TT--AAAGCTTGACTTAGTTATGATTAATG-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGGGCCCAAAGCAGCAGACTC-TCGGCGTAAATAGTGGCCAGAATAATT-ACCACCACATTAAAAACTAAACCATACTCTAACCGTAAAACATAGGCTAAATGAAATCAAACACTTTT-AATAACAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATTATGATACTAAAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCACACCGGCTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGTTAAACCTCACCAATCTTTGCCAAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTTAAT-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAATGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAAACTAAAACATA-CGGCACGGTACTATGAAACTCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAACTAACAAGAAAGTTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCGCGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCACACAA-CACA-------CATA--TACATAATC-AACATTTTCCCC---ACAAGATGAGGCA
[969]
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[977]
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[970]
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[843]
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[965]
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[963]
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[972]
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[974]
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[969]
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[968]
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[973]
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[969]
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[959]
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[973]
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[961]
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[971]
min_17b ??????GGGCCGAT-AAAAATCCCCAAAAACACACAGTTTTGGTCCTAAACTTACTGCTACTTTTAATCAAATTTACACATGCAAGCATCCACACACCAGTGAAATACGCCCTAACATAGCATAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAACTACTAGCCAAAAACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCCATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAAGACACCAAAC-TAT-AAAGCTTGACTTAGTTATGATTAATG-GGGCCGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGGGCCCAAAGCAGCAGACAC-TCGGCGTAAATAGTGGCTAGAATAATT-ACCACCACATTAAAAACTAAACCATATCCTAACCGTAAAACATAGGCTAAATGAAATCAAACACTTTT-AATAACAGGTAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATATGATATTATGATACTAAAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCACACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACCCCACGTTAAACCTCACCAATCTTTGCCAAATCAGCCTATATACCGCCGTCGTCAACCCACCTCATGAGAGAAAAACAGTGAGTACAAAAGTTTAAT-AACTAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGAGTGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAAACTAAAACATA-CGGCACGGTACTATGAAACTCTTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAACTAACAAGAAAGTTAATTTTAAACACGCTCTGGAGCGCGCACACACCGCCCGTCACCCTCATCTCACACAA-CACA-------CATA--TACATAATCAAC-ATTTTCCT---CACAAGATGAGGCA
[970]
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[969]
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[969]
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[969]
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[974]
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[971]
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[961]
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[896]
obe_Ib ????????????????????CCTAGCCGCCATCCTCCTAAAACTAGGAGGTTACGGCATTATACGAATCACAATAGCACTAACCCCAATTACCCCAAAACTCTACTACCCATTTATAATCCTTGCACTTTGAGGCATTGTTATAACAAGCTCAATCTGCATACGACAAACAGACCTAAAATCCCTCATCGCCTACTCATCAGTAAGCCACATAGGACTAGTCATTGCAGCCTGCCTCATCCAAACACCATGAAGCTTCACAGGAGCCATAATTCTAATAATTGCACATGGACTAACTTCATCAATACTATTCTGCTTAGCAAACACAAACTATGAACGAACCCACACCCGAACAATAATACTTGCGCGAGGCTTCCAAATTATTCTTCCACTTATATCAACCTGATGACTCCTAGCAAATTTAACTAACATAGCACTACCCCCTTCAATTAACCTAATAGGCGAACTTCTTATCATTATCTCATTATTCAACTGATCTGCCCCAACAATCCTATTAACCGGACTAGGAACACTAATTACAGCAATATATACACTCCACATATTTCTTACTACCCAACGAAATAAGCTACCAACAAACATCAACTTTTCTGACCCAACCCACACACGAGAACATCTTCTGATAACACTTCACCTAGCCCCACTAATCCTCATTATCACAAAACCTGCCCTAATCTCAGGACTAATCAACTGTTAGTATAGTTTAACAAAAACACTAGGCAGTGGCCCTAAAAACAGAAGTTT-AACCCTTCTTACAAACCAAGAGGTGTCTTGAACACCAAGAACTGCTAATTCTTACTACTGAAGTTAAAATCCTCAGACCTCTTACTTTTAAAGGATAAAAGTAATCCAATGGT??????????????????????
[896]
ornatus ???????????????ATAGTGCTAGCCGCTATCCTCCTAAAACTCGGAGGTTACGGCATTATACGAATCACAATAGCACTAACCCCAATTACCCCAAAACTCTACTACCCATTTATAATCCTTGCACTTTGGGGCATTGTCATAACAAGCTCAACCTGCATACGACAAACAGACCTAAAATCCCTCATCGCCTACTCATCAGTAAGCCACATAGGACTAGTTATTGCAGCCTGCCTGATCCAGACACCATGAAGTTTCACAGGAGCCATAATTCTAATAATTGCACATGGACTAACTTCATCAATACTATTCTGCCTGGCAAATACAAACTATGAACGAACCCACACCCGAACAATAATACTTGCCCGGGGCTTCCAAATGGTTCTCCCACTTATATCAACCTGATGACTTCTAGCAAATTTAACTAACATAGCGCTACCCCCATCAATTAACCTAATAGGCGAGCTTCTTATCATTGTTTCACTATTCAACTGATCTACTCCAACAATCCTATTAACCGGACTAGGAACACTAATTACAGCAATATATACACTTCACATGTTTCTTATTACCCAACGAAATAAACTACCAACAAGCATTAACTTTTCCGACCCAACTCACACACGAGAACATCTTCTGATAACACTTCACCTAACCCCACTAATCCTTATTATCATAAAACCCGCCCTAATTTCAGGACTAATCAACTGTTAGTATAGTTTAACAAAAACATTAGGCAGTGGCCCTAAAAACAGAAGTTT-AACCCTTCTTACAAACCAAGGGGTGTCTTGAACACCAAGAACTGCTAATTCTTACTACTGAAGTTAAAATCCTCAGACCTCTTACTTTTAAAGGATAAAAGTAATCCAATGGTCTTAGGAGCCAAAAACCTTG??
[896]
poinsettii ?????????????????GGTTCTAGCCGCTATCCTTCTAAAACTCGGGGGTTATGGTATTATACGAATTACAACATCACTAGCCCCACTTACGCCAAAACTTTACTACCCATTTATAATCCTTGCACTTTGAGGCATTGTTATAACAAGCTCGGTATGTATACGACAAACAGACCTAAAATCACTCATCGCTTACTCATCAGTTAGCCACATGGGACTAGTCATTGCAGCCTGCCTAATCCAAACACCATGAAGCTTCACAGGGGCCATAATTCTAATAATCGCACATGGACTCACTTCATCAATACTATTCTGCCTGGCAAACACAAACTATGAACGTACCCACACCCGAACAATAATGCTTGCCCGAGGATTCCAAATGATTCTTCCCCTTATATCAACCTGGTGACTTCTAGCAAACTTAACTAACATAGCACTACCACCATCAATTAACCTAATAGGAGAACTTCTTATCATCATTTCACTATTCAACTAGTCTAGCCCAACTATCTTATTAACGGGACTAGGAACACTAATCACAGCAATATATACACTTCACATATTTCTTACTACCCAACGAAACAAATTACCAACAAACATCAACTTTTCTGACCCCTCCCACACACGAGAGCACCTTCTAATAGCACTCCACCTAGCCCCCTTAATCCTTATTATCACAAAACCTGCCCTAATCTCAGGATTAATCAACTGTTAGTATAGTTTAACAAAAACATTAGGCAGTGGCCCTAAAAACAGAAGTTT-AACCCTTCTTACAAACCAAGAGGTGTCTTGAACACCAG--ACTGCTAATTCTTACTACTGAAGTTAAAGTCCTCAGACCTCTTACTTTTAAAGGATAGGAGTAATCCAATGGTCTTAGGCGCCAAAAACC?????
[894]
sug_21a CCAATTGCAGGATCAATAGTTCTAGCCGCTGTCCTTCTAAAACTAGGGGGTTACGGTATTATACGAATCACAATAGCACTAACCCCAATTACCCCAAAACTCTATTACCCATTTATAATCCTTGCACTTTGAGGTATCGTCATAACGAGCTCAATTTGCATACGACAAACAGACCTAAAATCACTCATTGCCTACTCATCAGTAAGCCACATAGGACTAGTCATTGCAGCCTGCCTGATCCAAACACCATGAAGCTTCACCGGAGCCATAATTCTAATAATCGCACATGGCCTCACTTCATCAATACTATTCTGCCTGGCAAACACAAACTATGAACGAACCAACACCCGAACAATGATACTTGCCCGGGGCTTCCAAATGATTCTCCCCCTTATATCAACCTGGTGGCTTCTAGCAAATTTAACCAACATAGCACTACCCCCATCAATTAACCTAATGGGAGAACTCCTCATCATTATCTCACTTTTCAACTGATCTAATCCAACAATCTTATTAACTGGACTAGGAACACTGATTACAGCAATATATACACTTCACATATTCCTCACTACCCAGCGTAGTAAACTACCAACAAACATTAACCTTTCTGACCCAACCCACACACGAGAACACCTTCTAATAATACTCCACCTAGCCCCACTAATCCTTATTATCACAAAACCTGCTCTAATCTCAGGCTTAATCAACTGTTAGTATAGTTTAACAAAAACATTAGGCAGTGGCCCTAAAAACAGAAGTTT-AACCCTTCTTACAAACCAAGAGGTGTCTTGAACACCAAGAACTGCTAATTCTTACTACTGAAGTTAAAATCCTCAGACCTCTTACTTTTAAAGGATAAAAGTAATCCAATGGTCTTAGGAACCAAAAATCCTGGG
[896]
sug_21b CCAATTGCAGGATCAATAGTTCTAGCCGCTGTCCTTCTAAAACTAGGGGGTTACGGTATTATACGAATCACAATAGCACTAACCCCAATTACCCCAAAACTCTATTACCCATTTATAGTCCTTGCACTTTGAGGTATCGTCATAACGAGCTCAATTTGCATACGACAAACAGACCTAAAATCACTCATTGCCTACTCATCAGTAAGCCACATAGGACTAGTCATTGCAGCCTGCCTGATCCAAACACCATGAAGCTTCACCGGAGCCATAATTCTAATAATCGCACATGGCCTCACTTCATCAATACTATTCTGCCTGGCAAACACAAACTATGAACGAACCAACACCCGAACAATGATACTTGCCCGGGGCTTCCAAATGATTCTCCCCCTTATATCAACCTGGTGGCTTCTAGCAAATTTAACCAACATAGCACTACCCCCATCAATTAACCTAATGGGAGAACTTCTCATCATTATCTCACTTTTCAACTGATCTAATCCAACAATCTTATTAACTGGACTAGGAACACTGATTACAGCAATATATACACTTCACATATTCCTCACTACCCAGCGTAGTAAACTACCAACAAACATTAACCTTTCTGACCCAACCCACACACGAGAACACCTTCTAATAATACTCCACCTAGCCCCACTAATCCTTATTATCACAAAACCTGCCCTAATCTCAGGCTTAATCAACTGTTAGTATAGTTTAACAAAAACATTAGGCAGTGGCCCTAGAAACAGAAGTTT-AACCCTTCTTACAAACCAAGAGGTGTCTTGAACACCAAGAACTGCTAATTCTTACTACTGAAGTTAAAATCCTCAGACCTCTTACTTTTAAAGGATAAAAGTAATCCAATGGTCTTAGGAACCAAAAA???????
[896]
torquatus CCAATTGCAGGATCAATGGTRCTAGCCGCCATTCTCCTAAAACTCGGAGGCTACGGCATTATACGCATCACAATATCACTAACCCCTATTACCCCAAAACTCTATTACCCATTTATAATCCTTGCATTATGGGGCATTGTTATAACAAGTTCAATTTGCATGCGACAAACAGACCTAAAATCACTTATCGCCTACTCATCAGTCAGCCACATGGGCTTAGTCATCGCAGCATGCCTAATCCAAACACCATGAAGCTTTACAGGCGCTATAATCCTAATAATCGCACACGGCCTTACCTCATCAATATTATTCTGTCTAGCTAACACAAACTACGAGCGAACTCACACCCGAACAATAATACTGGCCCGCGGCTTCCAAATTATCCTTCCACTTATGTCAACCTGGTGGCTCCTAGCGAACTTAACCAACATAGCACTACCCCCATCAATTAATCTAATAGGAGAACTTCTTATCATTATTTCACTATTCAACTGATCTAACCCGACAATTTTAATGACAGGACTAGGAACACTAATTACAGCAGTATACTCACTCCACATGTTCCTTATTACCCAACGAAATAAACTACCAACAAGCATTAATTTTTCTGACCCATCTCACACACGAGAACACCTCCTAATAATTCTTCACCTGGCCCCACTAACACTTATTATTGCAAAACCCGCCCTTATCTCAGGCCTGATCAACTGTTAGTATAGTTTAATAAAAACATTAGGCAGTGGCCCTAAAAATAGAAGTTC-AACCCTTCTTACAGACCAAGGGGTGTTTTGAACACCAAGAACTGCTAATTCTTACTACTGAAGTTAAAATCCTCAGACCTCTTACTTTTAAAGGATAAAAGTAATCCATTGGTCTTAGGA???????????????
[896]
;
END;
BEGIN TREES;
TRANSLATE
1 grammicus,
2 megalepidu,
3 dugesii,
4 cyanog_A,
5 cyanog_B,
6 cyanog_C,
7 cynst_1a,
8 cynst_1b,
9 cynst_2a,
10 cynst_2b,
11 ery_3,
12 ery_4a,
13 ery_4b,
14 imm_5c,
15 imm_5a,
16 imm_5b,
17 imm_6a,
18 imm_6b,
19 imm_III,
20 insignis,
21 jarr_8,
22 jarr_7a,
23 jarr_7b,
24 lineo,
25 min_9a,
26 min_14a,
27 min_14b,
28 min_9b,
29 min_17a,
30 min_17b,
31 min_15a,
32 min_15b,
33 min_16a,
34 min_16b,
35 min_18a,
36 min_18b,
37 min_10b,
38 min_10a,
39 min_12a,
40 min_12b,
41 min_11a,
42 min_11b,
43 min_13a,
44 min_13b,
45 min_IIa,
46 min_IIb,
47 mucronatus,
48 obe_19a,
49 obe_19b,
50 obe_20a,
51 obe_20b,
52 obe_Ia,
53 obe_Ib,
54 ornatus,
55 poinsettii,
56 sug_21a,
57 sug_21b,
58 torquatus
;
TREE * UNTITLED = [&R] (2,(1,(3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47,48,49,50,51,52,53,54,55,56,57,58)));
ENDBLOCK;