#NEXUS
[allozyme data for Eurycea study]
BEGIN DATA;
DIMENSIONS NTAX=13 NCHAR=25;
format symbols="A G C T 123456789XBYDEFZHIJKL" missing=? equate= "N=?" interleave;
MATRIX
[allozymes]
multiplicata 22Z5 3237 9225 2118 9X?Y ?8B5 2
chisholmensis 2112 1123 2211 1112 1111 5111 1
tonkawae 2112 1123 1211 1112 3111 4121 1
naufragia 1111 1111 1111 1111 1111 1111 1
rathbuni Y1D3 2129 3X21 2114 4138 K111 1
nana B2Y3 1126 3423 2112 41X7 J111 1
tridentifera 41B3 1195 3623 2113 6134 D181 1
latitans 5153 1144 3423 2122 4132 8331 1
sosorum 8193 1174 3523 5112 4163 5161 1
Comal 7183 1164 3423 2112 4131 B451 1
neotenes 41X3 1183 3423 2112 4431 Y571 1
pterophila 4173 1153 3423 4112 4351 X151 1
troglodytes 9113 11X3 3724 6142 7576 E191 1
;
end;
begin PAUP;BEGIN ASSUMPTIONS;USERTYPE A = 16 [Aco-1]
1 2 3 4 5 6 7 8 9 X B Y D E F Z
. 032 032 100 100 086 100 092 100 100 100 100 100 100 100 100
032 . 021 100 100 086 100 092 100 100 100 100 100 100 100 100
032 021 . 079 079 064 079 071 079 079 100 100 100 100 100 100
100 100 079 . 001 014 046 008 001 013 100 100 100 100 100 100
100 100 079 001 . 014 046 008 000 011 100 100 100 100 100 100
086 086 064 014 014 . 046 007 014 014 100 100 100 100 100 100
100 100 079 046 046 046 . 046 046 046 100 055 055 100 100 100
092 092 071 008 008 007 046 . 008 013 100 100 100 100 100 100
100 100 079 001 000 014 046 008 . 012 100 100 100 100 100 100
100 100 079 013 011 014 046 013 012 . 100 100 100 100 100 100
100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 . 100 050 100 100 100
100 100 100 100 100 100 055 100 100 100 100 . 050 100 100 100
100 100 100 100 100 100 055 100 100 100 050 050 . 100 100 100
100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 . 100 100
100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 . 050
100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 050 .

;

USERTYPE B = 2 [Ak]
1 2
. 100
100 .
;

USERTYPE C = 17 [Aat-S]
1 2 3 4 5 6 7 8 9 X B Y D E F Z H
. 001 014 075 099 054 097 059 096 009 041 100 040 100 100 100 100
001 . 013 074 099 054 097 059 096 009 041 100 039 100 100 100 100
014 013 . 061 099 054 097 059 096 014 041 100 026 100 100 100 100
075 074 061 . 099 075 097 075 096 075 075 100 035 100 100 100 100
099 099 099 099 . 045 001 040 002 090 058 100 099 100 100 100 100
054 054 054 075 045 . 044 005 043 045 013 100 054 100 100 100 100
097 097 097 097 001 044 . 038 001 089 057 100 097 100 100 100 100
059 059 059 075 040 005 038 . 037 050 019 100 059 100 100 100 100
096 096 096 096 002 043 001 037 . 088 056 100 096 100 100 100 100
009 009 014 075 090 045 089 050 088 . 032 100 040 100 100 100 100
041 041 041 075 058 013 057 019 056 032 . 100 041 100 100 100 100
100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 . 100 100 100 100 100
040 039 026 035 099 054 097 059 096 040 041 100 . 100 100 100 100
100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 . 100 100 100
100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 . 100 100
100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 . 100
100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 .

;

USERTYPE D = 6 [Ck-1]
1 2 3 4 5 6
. 036 100 064 100 100
036 . 100 100 100 100
100 100 . 100 100 100
064 100 100 . 100 100
100 100 100 100 . 100
100 100 100 100 100 .
;

USERTYPE E = 5 [Ck-2]
1 2 3 4 5
. 100 100 100 100
100 . 100 100 100
100 100 . 100 100
100 100 100 . 100
100 100 100 100 .

;

USERTYPE F = 3 [Cap]
1 2 3
. 100 100
100 . 100
100 100 .
;

USERTYPE G = 13 [Gpi]
1 2 3 4 5 6 7 8 9 X B Y D
. 007 093 008 006 039 047 022 009 004 087 027 093
007 . 100 015 001 046 054 028 016 003 093 033 100
093 100 . 085 099 055 046 094 084 097 007 067 075
008 015 085 . 014 031 039 022 001 012 079 019 085
006 001 099 014 . 044 052 027 014 001 092 032 099
039 046 055 031 044 . 008 039 030 043 048 012 075
047 054 046 039 052 008 . 047 038 051 040 020 075
022 028 094 022 027 039 047 . 022 026 087 027 094
009 016 084 001 014 030 038 022 . 013 078 018 084
004 003 097 012 001 043 051 026 013 . 091 031 097
087 093 007 079 092 048 040 087 078 091 . 060 075
027 033 067 019 032 012 020 027 018 031 060 . 075
093 100 075 085 099 075 075 094 084 097 075 075 .

;

USERTYPE H= 9 [Gr]
1 2 3 4 5 6 7 8 9
. 046 050 050 047 100 100 050 100
046 . 004 096 093 100 100 025 100
050 004 . 100 097 100 100 025 100
050 096 100 . 003 100 100 100 100
047 093 097 003 . 100 100 097 100
100 100 100 100 100 . 100 075 100
100 100 100 100 100 100 . 100 100
050 025 025 100 097 075 100 . 100
100 100 100 100 100 100 100 100 .

;

USERTYPE I = 10 [Gapdh]
1 2 3 4 5 6 7 8 9 X
. 013 100 100 100 100 100 100 100 100
013 . 088 088 100 100 100 100 100 100
100 088 . 082 100 100 100 100 100 100
100 088 082 . 018 100 100 100 100 100
100 100 100 018 . 100 100 100 100 100
100 100 100 100 100 . 100 100 100 100
100 100 100 100 100 100 . 100 100 100
100 100 100 100 100 100 100 . 100 100
100 100 100 100 100 100 100 100 . 100
100 100 100 100 100 100 100 100 100 .

;

USERTYPE J = 11 [G3pdh]
1 2 3 4 5 6 7 8 9 X B
. 100 093 100 100 100 100 100 100 100 100
100 . 007 100 100 100 100 100 100 100 100
093 007 . 100 100 100 100 100 100 100 100
100 100 100 . 011 069 033 097 100 070 100
100 100 100 011 . 058 022 086 089 059 100
100 100 100 069 058 . 036 028 031 001 100
100 100 100 033 022 036 . 064 068 038 100
100 100 100 097 086 028 064 . 003 027 100
100 100 100 100 089 031 068 003 . 030 100
100 100 100 070 059 001 038 027 030 . 100
100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 .
;

USERTYPE K = 8 [Idh-1]
1 2 3 4 5 6 7 8
. 100 100 100 100 100 100 100
100 . 080 100 100 100 100 025
100 080 . 100 100 100 100 080
100 100 100 . 100 100 100 100
100 100 100 100 . 100 100 100
100 100 100 100 100 . 100 100
100 100 100 100 100 100 . 100
100 025 080 100 100 100 100 .

;

USERTYPE L = 6 [Idh-2]
1 2 3 4 5 6
. 014 100 097 100 100
014 . 086 082 100 100
100 086 . 004 100 100
097 082 004 . 100 100
100 100 100 100 . 100
100 100 100 100 100 .

;

USERTYPE M = 9 [Ldh-A]
1 2 3 4 5 6 7 8 9
. 100 100 100 100 100 100 100 100
100 . 043 007 004 006 088 100 100
100 043 . 043 043 043 088 100 100
100 007 043 . 003 001 088 100 100
100 004 043 003 . 003 088 100 100
100 006 043 001 003 . 088 100 100
100 088 088 088 088 088 . 100 100
100 100 100 100 100 100 100 . 100
100 100 100 100 100 100 100 100 .
;

USERTYPE N = 4 [Ldh-B]
1 2 3 4
. 100 050 100
100 . 100 100
050 100 . 050
100 100 050 .

;
USERTYPE O = 6 [Mdh-1]
1 2 3 4 5 6
. 005 090 015 100 100
005 . 090 015 100 100
090 090 . 090 100 100
015 015 090 . 100 100
100 100 100 100 . 100
100 100 100 100 100 .

;

USERTYPE P = 11 [Mdh-2]
1 2 3 4 5 6 7 8 9 X Y
. 002 001 100 100 100 100 100 100 100 100
002 . 003 100 100 100 100 100 100 100 100
001 003 . 100 100 100 100 100 100 100 100
100 100 100 . 100 100 100 100 100 100 100
100 100 100 100 . 100 100 100 100 100 100
100 100 100 100 100 . 100 100 100 100 100
100 100 100 100 100 100 . 100 100 100 100
100 100 100 100 100 100 100 . 100 100 100
100 100 100 100 100 100 100 100 . 100 100
100 100 100 100 100 100 100 100 100 . 100
100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 .
;

USERTYPE Q = 13 [Mdhp]
1 2 3 4 5 6 7 8 9 X B Y D
. 016 006 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100
016 . 010 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100
006 010 . 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100
100 100 100 . 007 097 002 067 100 100 100 100 100
100 100 100 007 . 097 007 067 100 100 100 100 100
100 100 100 097 097 . 097 097 100 100 100 100 100
100 100 100 002 007 097 . 065 100 100 100 100 100
100 100 100 067 067 097 065 . 100 100 100 100 100
100 100 100 100 100 100 100 100 . 100 025 100 100
100 100 100 100 100 100 100 100 100 . 100 075 067
100 100 100 100 100 100 100 100 025 100 . 100 100
100 100 100 100 100 100 100 100 100 075 100 . 075
100 100 100 100 100 100 100 100 100 067 100 075 .

;

USERTYPE R = 13 [Mpi]
1 2 3 4 5 6 7 8 9 X B Y D
. 046 024 097 018 003 100 050 100 100 100 075 100
046 . 022 051 046 046 054 050 100 100 100 075 100
024 022 . 073 023 024 076 050 100 100 100 075 100
097 051 073 . 096 097 003 097 100 100 100 097 100
018 046 023 096 . 018 099 050 100 091 100 075 100
003 046 024 097 018 . 100 050 100 100 100 075 100
100 054 076 003 099 100 . 100 100 100 100 100 100
050 050 050 097 050 050 100 . 100 100 100 075 100
100 100 100 100 100 100 100 100 . 025 100 100 100
100 100 100 100 091 100 100 100 025 . 100 100 075
100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 . 025 100
075 075 075 097 075 075 100 075 100 100 025 . 100
100 100 100 100 100 100 100 100 100 075 100 100 .


;

USERTYPE S = 10 [Pep-A]
1 2 3 4 5 6 7 8 9 X
. 007 100 096 100 083 100 100 100 038
007 . 093 089 093 083 093 100 100 030
100 093 . 004 001 100 021 100 100 063
096 089 004 . 004 096 021 100 100 059
100 093 001 004 . 100 020 100 099 063
083 083 100 096 100 . 100 100 100 083
100 093 021 021 020 100 . 091 088 063
100 100 100 100 100 100 091 . 100 100
100 100 100 100 099 100 088 100 . 100
038 030 063 059 063 083 063 100 100 .
;

USERTYPE T = 13 [Pep-B]
1 2 3 4 5 6 7 8 9 X B Y D
. 008 007 073 100 099 100 010 100 100 100 100 075
008 . 001 066 092 091 100 010 100 100 100 100 075
007 001 . 066 093 092 100 010 100 100 100 100 075
073 066 066 . 027 026 100 073 100 100 100 100 075
100 092 093 027 . 001 100 100 100 100 100 100 100
099 091 092 026 001 . 100 099 100 100 100 100 099
100 100 100 100 100 100 . 090 100 100 100 100 025
010 010 010 073 100 099 090 . 100 100 100 100 065
100 100 100 100 100 100 100 100 . 100 100 100 100
100 100 100 100 100 100 100 100 100 . 100 100 100
100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 . 100 100
100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 . 100
075 075 075 075 100 099 025 065 100 100 100 100 .

;

USERTYPE U = 20 [Pep-D]
1 2 3 4 5 6 7 8 9 X B Y D E F Z H I J K
. 098 098 098 003 100 098 100 100 100 100 100 094 097 100 100 098 100 100 100
098 . 082 094 100 096 004 100 100 100 100 100 089 095 100 100 075 100 100 100
098 082 . 094 100 014 086 100 100 100 100 100 089 095 100 100 086 100 100 100
098 094 094 . 100 100 094 007 007 014 006 021 087 024 010 050 094 075 100 100
003 100 100 100 . 100 100 100 100 100 100 100 096 099 100 100 100 100 100 100
100 096 014 100 100 . 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100
098 004 086 094 100 100 . 100 100 100 100 100 089 095 100 100 075 100 100 100
100 100 100 007 100 100 100 . 001 007 007 015 086 022 003 043 093 068 100 087
100 100 100 007 100 100 100 001 . 006 007 014 085 022 003 043 093 068 100 093
100 100 100 014 100 100 100 007 006 . 014 008 079 015 004 037 087 062 100 086
100 100 100 006 100 100 100 007 007 014 . 021 092 029 010 050 100 075 100 100
100 100 100 021 100 100 100 015 014 008 021 . 071 007 011 029 079 054 100 080
094 089 089 087 096 100 089 086 085 079 092 071 . 064 082 042 014 017 100 081
097 095 095 024 099 100 095 022 022 015 029 007 064 . 019 027 072 052 100 080
100 100 100 010 100 100 100 003 003 004 010 011 082 019 . 040 090 065 100 090
100 100 100 050 100 100 100 043 043 037 050 029 042 027 040 . 050 025 100 080
098 075 086 094 100 100 075 093 093 087 100 079 014 072 090 050 . 025 100 080
100 100 100 075 100 100 100 068 068 062 075 054 017 052 065 025 025 . 100 080
100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 . 100
100 100 100 100 100 100 100 087 093 086 100 080 081 080 090 080 080 080 100 .
;

USERTYPE V = 8 [Pgm]
1 2 3 4 5 6 7 8
. 001 001 063 066 010 100 025
001 . 000 063 066 010 100 025
001 000 . 063 066 010 100 025
063 063 063 . 003 053 038 063
066 066 066 003 . 056 034 067
010 010 010 053 056 . 090 025
100 100 100 038 034 090 . 100
025 025 025 063 067 025 100 .

;

USERTYPE W = 13 [Pgdh]
1 2 3 4 5 6 7 8 9 X B Y D
. 006 061 096 100 021 063 037 001 025 100 100 050
006 . 055 091 094 016 057 031 006 025 100 100 051
061 055 . 057 061 040 049 024 060 042 099 100 060
096 091 057 . 004 075 084 060 096 096 100 100 096
100 094 061 004 . 079 088 063 100 100 100 100 100
021 016 040 075 079 . 050 015 021 025 100 100 050
063 057 049 084 088 050 . 050 063 063 063 100 063
037 031 024 060 063 015 050 . 037 037 100 100 050
001 006 060 096 100 021 063 037 . 024 100 100 050
025 025 042 096 100 025 063 037 024 . 100 100 050
100 100 099 100 100 100 063 100 100 100 . 100 100
100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 . 100
050 051 060 096 100 050 063 050 050 050 100 100 .
;

USERTYPE X = 6 [Pk]
1 2 3 4 5 6
. 100 100 100 100 100
100 . 100 100 100 100
100 100 . 100 100 100
100 100 100 . 025 100
100 100 100 025 . 075
100 100 100 100 075 .

;

USERTYPE Y = 2 [Sod-S]
1 2
. 100
100 .

;

TYPESET *ALLWTS = A:1, B:2, C:3, D:4, E:5, F:6, G:7, H:8, I:9, J:10, K:11, L:12, M:13, N:14, O:15, P:16, Q:17, R:18, S:19, T:20, U:21, V:22, W:23, X:24, Y:25;
end;
;
end;